混合性白血病基因組研究獲進展
近日,中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員王前飛與美國芝加哥大學血液學教授Michael J. Thirman合作開展的“MLL融合蛋白在急性白血病中 的致病機制研究”取得階段性進展,其研究論文《MLL融合蛋白在白血病基因組中選擇性調(diào)控MLL野生型的部分靶基因》 (MLL Fusion Proteins Preferentially Regulate a Subset of Wild Type MLL Target Genes in the Leukemic Genome) 于近日在《血液》(Blood)雜志發(fā)表。該項成果揭示了MLL融合蛋白通過選擇性調(diào)控野生型MLL蛋白的部分靶基因,進而推動急性白血病發(fā)生的致病機 制,為我國白血病及其腫瘤基因組研究起到了積極推動意義。
MLL白血病是一類預后不良的血液系統(tǒng)惡性腫瘤,由于染色體易位形成MLL融合蛋白而得名。野生型 MLL(Mixed Lineage Leukemia)基因編碼一種組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,通過催化H3K4甲基化而激活一系列在血細胞分化和發(fā)育過程中起 關鍵作用的基因表達。染色體易位后形成的MLL融合蛋白通過募集組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶DOT1L來催化H3K79甲基化,引起全基因組轉(zhuǎn)錄表達的紊亂。然而, 失衡的轉(zhuǎn)錄組中哪些是MLL融合蛋白的直接靶基因和關鍵的致病通路,目前尚未有較系統(tǒng)和全面的研究。
為了闡述這一重要問題,王前飛研究員及其實驗室成員通過采用兩套平行方案,即比較人源白血病細胞系的MLL結合、聯(lián)合分析可誘導MLL-ENL小鼠模 型的靶基因定位與表達譜,發(fā)現(xiàn)了MLL融合蛋白結合的靶基因是野生型MLL蛋白靶基因的一部分(圖A)。研究還發(fā)現(xiàn),在誘導MLL-ENL小鼠模型 中,MLL融合蛋白的結合與H3K79甲基化水平的改變僅局限于部分基因組區(qū)域,并由此界定了223個MLL-ENL結合的靶基因。令人吃驚的是,在誘導 產(chǎn)生MLL-ENL融合蛋白后,MLL融合蛋白結合的絕大部分靶基因沒有顯示出mRNA表達水平的顯著改變;只有12個靶基因的mRNA水平顯著升高,被 定義為MLL-ENL調(diào)控靶基因。除了已知的HOXA9/MEIS1,研究還發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)錄因子EYA1、SIX1和SIX4是MLL-ENL的直接靶點,而 且EYA蛋白已知能與SIX蛋白家族成員形成異二聚體,因此提示了EYA1/SIX1很可能是急性白血病中MLL融合蛋白介導的一種新的致病通路。研究人 員進一步通過造血細胞轉(zhuǎn)化實驗,證明了EYA1與SIX1協(xié)同作用能使造血祖細胞在體外永生化。
總之,該研究揭示了MLL融合蛋白通過選擇性調(diào)控野生型MLL蛋白的部分靶基因而推動急性白血病發(fā)生的致病機制,表明了EYA1/SIX1很可能是 急性白血病中MLL融合蛋白介導的一種新的致病通路,為深入開展白血病的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機理研究奠定了良好基礎。目前,該實驗室正綜合運用ChIP-seq和 RNA-seq系統(tǒng)研究MLL白血病中關鍵的microRNA靶基因和相關的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡,并對MLL白血病病人進行全基因組重測序。研究人員期望聯(lián)合實 驗血液學以及強大的基因組學技術平臺,解讀正常與白血病基因組,并由此加深對人類癌癥的理論認識,為設計分子手段治療血癌提供可能的靶點。
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