克山病的病因目前尚不清楚，可分微生物地球化學(xué)病因和生物病因?？松讲∪堪l(fā)生在低硒地帶，患者頭發(fā)和血液中的硒明顯低于非病區(qū)居民，而口服亞硒酸鈉可以預(yù)防克山病的發(fā)生，說(shuō)明硒與克山病的發(fā)生有關(guān)。但鑒于病區(qū)雖然普遍低硒，而發(fā)病僅占居民的一小部分，且缺硒不能解釋克山病的年度和季節(jié)多發(fā)，所以還應(yīng)考慮克山病的發(fā)生除低硒外尚有多種其他因素參與的可能。

　　生物病因?qū)W說(shuō)認(rèn)為，克山病可能是由病毒、尤其是腸道病毒感染或食物真菌毒素中毒引起。 迄今尚未闡明。根據(jù)各地進(jìn)行的大量研究，可能與水土、營(yíng)養(yǎng)、感染等因素有關(guān)。

　　（一）水土和營(yíng)養(yǎng)因素

　　據(jù)調(diào)查本病有明顯的地區(qū)性，病區(qū)的土壤、水質(zhì)和糧食中缺乏某些人體需要的微量元素如硒、鉬、鎂等或有關(guān)的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，從而干擾了心肌代謝，引起心肌或損傷而罹病。中國(guó)科學(xué)院克山病防治組進(jìn)行了病區(qū)和非病區(qū)內(nèi)外環(huán)境中硒的測(cè)定，發(fā)現(xiàn)病區(qū)的水和糧食中硒含量明顯降低，病區(qū)人群的血硒和頭發(fā)硒含量亦低。并調(diào)查，從水土含硒量低的病區(qū)到相鄰的水土含硒較高地區(qū)，發(fā)現(xiàn)其糧食中硒的含量升高，本病亦減少。

　　多年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)缺硒可使一些動(dòng)物發(fā)生心肌病變，并致細(xì)胞免疫及機(jī)體免疫功能下降，表現(xiàn)為抗體生成減少，對(duì)抗原反應(yīng)降低，吞噬能力下降。醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理適量的硒對(duì)缺硒造成的心肌損害有明顯保護(hù)作用及抗氧化能力。且可改善機(jī)體抗感染的能力。硒又是谷胱甘肽過(guò)氧化物酶（GSH-px）的一個(gè)組成成份，該酶的主要作用是還原脂質(zhì)過(guò)氧化物，清除氧自由基從而保護(hù)了細(xì)胞膜的完整性，低硒可使GSH-px活性降低，造成心肌膜系統(tǒng)損傷。近年研究尚發(fā)現(xiàn)亞硝酸鈉可使低硒機(jī)體心肌谷胱甘肽過(guò)氧化物酶活性明顯下降，補(bǔ)充硒或維生素E可保護(hù)此酶活力，提示除低硒外亞硝酸鹽過(guò)多及維生素E缺乏可能參與了克山病發(fā)病環(huán)節(jié)。硒缺乏實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的心肌標(biāo)本作電鏡和細(xì)胞化學(xué)檢查（細(xì)胞色素氧化酶、酸性磷酸酶和Ca₂⁺ATP酶），顯示心肌膜呈不同程度損傷；心肌氧化磷酸化障礙，氧利用低，ATP合成減少。細(xì)胞器內(nèi)ATP依存在鈣的調(diào)節(jié)運(yùn)轉(zhuǎn)異常，導(dǎo)致細(xì)胞器和收縮成分一系列改變。

　　近年有研究報(bào)告，低鎂（紅細(xì)胞及血漿中鎂含量顯著降低），亦可能是本病病因之一，并提出鎂治療本病及其心律失常之必要性。

　　（二）感染

　　有人認(rèn)為本病為感染所引起，特別是嗜心肌病毒感染，如柯薩奇病毒、?？刹《镜纫鸬男募⊙谆蚋腥具^(guò)敏性心肌炎或霉菌毒素引起中毒性心肌炎等。目前對(duì)感染在克山病病因中的作用尚待進(jìn)一步研究。亦有人認(rèn)為病毒感染與病區(qū)水土、營(yíng)養(yǎng)因素有協(xié)同作用而致病。

　　總之，本病病因未完全明確，可能在低硒的基礎(chǔ)上，各種綜合因素參與相互作用而致病。