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根據(jù)側(cè)鏈R的極性不同分為非極性和極性氨基酸。

氨基酸的R基團(tuán)不帶電荷或極性極微弱的屬于非極性中性氨基酸，如：甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蛋氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、脯氨酸。它們的R基團(tuán)具有疏水性。

氨基酸的R基團(tuán)帶電荷或有極性的屬于極性氨基酸，它們又可分為：

（1）極性中性氨基酸：R基團(tuán)有極性，但不解離，或僅極弱地解離，它們的R基團(tuán)有親水性。如：絲氨酸、蘇氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、谷氨酰胺、天門冬酰胺。

（2）酸性氨基酸：R基團(tuán)有極性，且解離，在中性溶液中顯酸性，親水性強(qiáng)。如天門冬氨酸、醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理谷氨酸。

（3）堿性氨基酸：R基團(tuán)有極性，且解離，在中性溶液中顯堿性，親水性強(qiáng)。如組氨酸、賴氨酸、精氨酸。

這20種氨基酸都有各自的遺傳密碼，它們是生物合成蛋白質(zhì)的構(gòu)件，無(wú)種屬差異。在體內(nèi)，一些特殊蛋白質(zhì)分子中還含有其它氨基酸，如甲狀腺球蛋白中碘代酪氨酸，膠原蛋白中的羥脯氨酸及羥賴氨酸，某些蛋白質(zhì)分子中的胱氨酸等，它們都是在蛋白質(zhì)生物合成之后（或合成過(guò)程中），相應(yīng)的氨基酸殘基被修飾形成的。還有的是在物質(zhì)代謝過(guò)程中產(chǎn)生，如鳥氨酸（由精氨酸轉(zhuǎn)變來(lái)的等，這些氨基酸在生物體內(nèi)都沒(méi)有相應(yīng)的遺傳密碼。