浙江中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)系創(chuàng)建于1986年，前身為中醫(yī)藥系。下設(shè)中藥學(xué)專業(yè)、藥物制劑專業(yè)和藥學(xué)專業(yè)、食品科學(xué)和工程專業(yè)，是目前國內(nèi)藥學(xué)專業(yè)門類較齊全，中、西藥兩在領(lǐng)域并蓄，具有本科生、碩士生、博士生等多層次人才培養(yǎng)能力的少數(shù)院校之一。現(xiàn)有中藥學(xué)、藥理學(xué)碩士點2個，與上海中醫(yī)藥大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)中藥專業(yè)博士。中藥學(xué)科為省級重點學(xué)科、醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理省中醫(yī)藥重點學(xué)科，其所屬的中藥新產(chǎn)品制劑研究室為省級重點實驗室，是新世紀(jì)全國高等中醫(yī)藥院校規(guī)劃教材《藥理學(xué)》、《藥用植物學(xué)》的主編單位�，F(xiàn)有正高級職9人，副高級職稱18人，國家食品藥品評審專家1名，博士生導(dǎo)師2名，全國著名藥理專家2名，省“新世紀(jì)151人才工程”重點資助培養(yǎng)人員一人、第一層次二人、第二層次一人，省高校中青年學(xué)科帶頭人3人。設(shè)有7個教研室和三個研究室。

近幾年來，承擔(dān)科研課題近65項，其中國家級9項、省部級28項，鑒定課題33項，技術(shù)協(xié)作或轉(zhuǎn)讓18項，2001～2002年科研和新產(chǎn)品開發(fā)橫向課題等收入350多萬元，開發(fā)中藥產(chǎn)品2個。1996年，本系被國家中醫(yī)藥管理局確定為執(zhí)業(yè)藥師培訓(xùn)點。執(zhí)業(yè)藥師資格考試前培訓(xùn)連續(xù)六年考試通過率在50%以上，位居國內(nèi)全部培訓(xùn)點之首。