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細(xì)菌性疾病的診斷，除個別因有特殊臨床癥狀不需細(xì)菌學(xué)診斷外（如破傷風(fēng)引起的典型攣等）一般均需進(jìn)行細(xì)菌學(xué)診斷以明確病因。然而自標(biāo)本中分離到細(xì)菌并不一定意味該菌為疾病的病原，因此應(yīng)根據(jù)病人的臨床情況、采集標(biāo)本的部位、獲得的細(xì)菌種類進(jìn)行綜合分析。例如自腦脊液中分離出腦膜炎球菌與自鼻咽部可存在腦膜炎球菌的意義即有不同。因腦脊液正常應(yīng)無菌存在，而5～10%正常人的鼻咽部分可存在腦膜炎球菌，為健康帶菌者。又如自血培養(yǎng)中分離到表皮葡萄球菌則應(yīng)根據(jù)患者免疫狀態(tài)以及有無因采血時污染皮膚上存在的正常菌群進(jìn)行分析，或再次作血培養(yǎng)，作血漿凝固酶測定，醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理以確定其病原性。分離到的細(xì)菌常需做藥物敏感試驗，以供選用適當(dāng)?shù)乃幬?。有時尚需做毒力試驗以確定該菌株的致病性。由于細(xì)菌及其代謝產(chǎn)物具有抗原性，細(xì)菌性感染還可通過檢測抗體進(jìn)行診斷。此外，近年來還發(fā)展起來通過檢測細(xì)菌的遺傳物質(zhì)對細(xì)菌的遺傳物質(zhì)對細(xì)菌進(jìn)行診斷的新方法—基因診斷方法。細(xì)菌可能過變異株制備活菌苗，也可殺死細(xì)菌保存其抗原性以制備死菌苗。產(chǎn)生外毒素菌制備的類毒素、抗毒素等均有特異性防治的應(yīng)用價值。