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生物催化劑的新來(lái)源

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生物催化劑的新來(lái)源:

生物催化劑傳統(tǒng)依賴培養(yǎng)的篩選方法其實(shí)損失了絕大部分微生物資源。由于占群落中絕大部分的微生物不能培養(yǎng),使得科學(xué)家發(fā)展了一種新方法。這種方法不需要預(yù)先培養(yǎng)就能開發(fā)這些微生物的基因組以用于生物技術(shù)。這一令人興奮的研究領(lǐng)域被稱為宏基因組學(xué)。宏基因組是指特定環(huán)境全部生物遺傳物質(zhì)總和,決定生物群體生命現(xiàn)象。

從來(lái)源于宏基因組DNA構(gòu)建的文庫(kù)中篩選新生物催化劑或基因的策略有兩種:基于活性(功能)的篩選和基于序列的篩選。無(wú)論是那種方法都要首先用合適的載體和宿主構(gòu)建DNA文庫(kù),構(gòu)建小片段(<10kb)文庫(kù)可使用常規(guī)的克隆載體,但這種文庫(kù)難以檢測(cè)到大基因簇和操縱子,為了突破這種限制,研究者開始構(gòu)建大片段基因文庫(kù)。常用的載體為柯斯質(zhì)粒(允許插入片段的長(zhǎng)度為25~35 kb)和BAC (約200kb)。大腸桿菌仍是最常用的宿主菌。

基于活性的篩選首先要確定能表達(dá)出所需特性的克隆,然后通過序列和生化分析表征這些克隆,這種方法能較快地找到可用于工農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥的蛋白質(zhì)和天然產(chǎn)物。另一種基于序列篩選的手段是對(duì)宏基因組克隆進(jìn)行測(cè)序,無(wú)論是全部或隨機(jī)測(cè)序都是一種發(fā)現(xiàn)新基因的有效手段。

兩種篩選方法各有優(yōu)缺點(diǎn),互相補(bǔ)充,將二者巧妙結(jié)合就能從天然分子庫(kù)巾取得最大收獲。

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