紅豆杉的藥用價值主要體它的提取物—次生代謝衍生物—紫杉醇。紫杉醇最早是從短葉紅豆杉的樹皮中分離出來的抗腫瘤活性成份。是治療轉移性卵巢癌和乳腺癌的最好藥物之一，同時對肺癌、食道癌也有顯著療效，對腎炎及細小病毒炎癥有明顯抑制。

紅豆杉的根、莖、葉都可以入藥，醫(yī)學|教育網搜集整理可以治療尿不暢、消除腫痛，對于：糖尿病、女性月經不調、血量增加都有治療作用。紅豆杉也可以用于產后調理，對女性病癥具有一定的治療作用。