漢代的醫(yī)官中職位最高者為太醫(yī)令丞，隸屬關(guān)系上分為兩個系統(tǒng)：

　　太常系統(tǒng)。“景帝中元六年（公元前144年）更名太常。屬官有太樂、太祝、太宰、太史、太卜、太醫(yī)令丞。”（《漢書·百宮公卿表》第七上）。當時的太醫(yī)令丞，相當于后世太醫(yī)院使，其內(nèi)部有分工，負責與管理方藥者各司其職，管理方藥者又有典須方藥和本草侍詔之分。典領(lǐng)方藥側(cè)重于方劑的研制，以供宮廷方藥之需。而本草待詔則主要為皇家采集各種藥材，這些人不象典領(lǐng)方藥官職穩(wěn)定，用著時被征詔上來，又隨時可能破裁減。

　　二是少府系統(tǒng)。“少府，秦官，掌山海池澤之稅，以給供養(yǎng)，有六丞。醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理屬官有尚書、符節(jié)、太醫(yī)、太官、湯官、導官、樂府、若盧、考工室、左弋居室、甘泉居室，左右司空、東織西織，東園匠”等令（《漢書·百官公卿表》第七上）。少府太醫(yī)主要為宮廷醫(yī)療服務。在少府太醫(yī)令丞下，屬官和醫(yī)藥人員有：太醫(yī)監(jiān)，多由有權(quán)勢的醫(yī)生充任，漢昭帝時權(quán)臣上官桀，其“妻父所幸充國為太醫(yī)監(jiān)。”（《漢書·孝昭上官皇后》）。漢代的侍醫(yī)，沿襲秦制，主要為帝王皇室和諸侯王診治疾病，相當于后世的侍御醫(yī)?！稘h書·王嘉傳》中的侍醫(yī)伍宏，在“董賢傳”中稱“醫(yī)待詔”，為同一職稱。女侍醫(yī)、女醫(yī)、乳醫(yī)，在宮中主要為皇后、公主等服務，診治婦產(chǎn)科疾病。

　　諸侯王府的醫(yī)政仿照中央，如西漢同姓諸侯王府，濟北王有太醫(yī)高期、王禹；齊王有侍醫(yī)。另外，王府中其他人也有喜好醫(yī)方者。王府一方面培養(yǎng)自己的醫(yī)生，派人去名醫(yī)那里請教、或拜名醫(yī)為師求學深造。地方官吏家中，也多有醫(yī)藥的設施。例如西漢高永侯的管家杜信，曾向淳于意學習《脈經(jīng)》、《五色診》等達兩年。1973年在長沙馬王堆出土的14種醫(yī)藥簡帛書，為西漢時之一例。

　　地方的郡、縣、鄉(xiāng)、亭四級機構(gòu)中，有關(guān)醫(yī)事制度的可鑒史料較少。在縣級政權(quán)中可能沿用了以前法醫(yī)檢驗組織。亭一級設專門掌營“開閉掃除”（《史記·高祖本紀》集解，見馬非百《秦集史》第494頁，中華書局1982年版）事務的亭父，由此可想知在郡、縣，鄉(xiāng)級的行政機構(gòu)中，也會有掌管或兼管醫(yī)藥衛(wèi)生之官吏。下層人民“戌者死于邊，輸者僨于道。”（《漢書·主父偃傳》）。“百姓靡敝，孤寡老弱不能相養(yǎng)，道死者相望。”（《漢書·晁錯傳》），缺醫(yī)少藥是顯然可見的。

　　新莽時期設有太醫(yī)尚方。史載“翟義黨王孫慶捕得，莽使太醫(yī)尚方與巧屠共刳剝之，量度五藏，以竹筵導其脈知所終始，云可以治病。”（《漢書·王莽傳》）

　　東漢時期撤消了太常系統(tǒng)，只在少府中設立太醫(yī)令丞一人，六百石，掌諸醫(yī)。下屬醫(yī)生293人，員吏19人負責診療及有關(guān)事項。此外，還有藥丞、方丞各一人，分別掌握藥物和醫(yī)方。

　　宮廷中從事醫(yī)務的人員還有：太醫(yī)、侍醫(yī)主要從事醫(yī)療工作；尚藥監(jiān)、中宮藥長和嘗藥太官，主要從事藥物的修和調(diào)試。“宮中藥長一人，四百石。”（《后漢書·百官志》）。從東漢章帝、和帝以后，宮中官制設置擴大，增設的嘗藥太官之職，主要負責嘗藥。東漢時期侍疾嘗藥由專人負責，所嘗藥量要超過該劑藥量的十分之二以上，且嘗藥不僅限于嘗藥監(jiān)一職?！逗鬂h書》載“（帝）不豫，太醫(yī)令丞將醫(yī)入，就所宜藥，嘗藥監(jiān)、近臣、中常侍、小黃門、皆先嘗藥，過量十二，公卿朝臣問起居無間。”（《后漢書·禮儀下》）

　　宮廷中所需藥物，一般從全國各地入貢。漢代各郡國每年要問宮廷貢獻地方的名貴藥材。對某些欠缺藥材，太醫(yī)令丞要及時派員采購。順帝時皇太子因病缺藥，朝廷即派人“下郡國縣出珍藥”。（《后漢書·延篤列傳》）。東漢朝臣也配有醫(yī)官（相當于保健醫(yī)生），除大鴻臚五人官醫(yī)外，廷尉、衛(wèi)尉、太仆、宗正、大司農(nóng)、少府也各有一名官醫(yī)（《后漢書·百官志》）。

　　東漢的醫(yī)官制度較西漢完善，增設了一些醫(yī)藥官職，地方醫(yī)事不再由中央直接管理，而由地方負責。在諸候王國中設“醫(yī)工長”，以“主醫(yī)藥”。（《后漢書·百官志》）在河北滿城中山靖王劉勝墓中曾出土帶有“醫(yī)工”字樣的銅盆。

　　漢代的醫(yī)生，可分為官醫(yī)與民間醫(yī)生。官醫(yī)的服務對象重點是官僚統(tǒng)治階層，從中央到地方形成了一支有組織的醫(yī)療系統(tǒng)。民間以師帶徒傳授醫(yī)學的教育形式有一定發(fā)展，但官辦的醫(yī)學教育尚未形成，醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理官醫(yī)主要從民間醫(yī)藥人士中選用，（《漢書·龔勝傳》），有的可能為臨時延聘。漢平帝元始五年（公元5年），“征天下通知逸經(jīng)、古記、天文、歷算、鐘律、小學、史篇、方術(shù)、本草、及以五經(jīng)、《論語》、《孝經(jīng)》、《爾雅》教授者，一遣詣京師，至者數(shù)千人。”（《漢書·平帝紀》）但有時則裁減官醫(yī)，如西漢時令“侯紳方士、使者、副使、本草待詔七十余人皆歸家。”（《漢書·郊祀志》），官醫(yī)除了主要為統(tǒng)治者服務外，有些還被指派去為軍中士卒、一般平民、甚至為刑徒、囚犯診病。東漢京兆尹陳龜派官醫(yī)為平民治病。東漢時會稽發(fā)生大疫，督郵鐘離意派官醫(yī)“經(jīng)給醫(yī)藥，所部多全濟。”（《后漢書·鐘離意列傳》），孔融在《肉刑論》中說“置南甄宮使者，主養(yǎng)病徒。”桓帝建和三年詔稱：“徒在作部，疾病致醫(yī)藥。”（《后漢書·恒帝紀》），又據(jù)洛陽南郊出土的東漢范雍磚志所記：“右部無任勉刑，穎川穎陰鬼薪范雍，不能去，留官致醫(yī)。”即是讓滿刑的病徒繼續(xù)在刑徒區(qū)接受治療。

　　漢代的醫(yī)療機構(gòu)已逐漸形成。西漢時的“乳舍”，相當于產(chǎn)院。據(jù)《風俗通義》記載：“汝南周霸，字翁仲，為太尉椽。婦于乳舍生女，自毒無男。時屠婦比臥生男，因相與私貨易，裨錢數(shù)萬。”，“穎川有富室，兄弟同居，兩婦數(shù)月皆懷妊，長婦胎傷，因閉匿之。產(chǎn)期至，同到乳母舍，弟婦主男，夜因盜取之，爭訟三年，州郡不能決。”（《太平御覽》卷361），汝南、穎川均為漢代州郡，而更大一些的州郡及都市也可能設有乳舍，并且住院的產(chǎn)婦中有屠夫之妻，說明產(chǎn)院并不專為統(tǒng)治階層而設?！逗鬂h書·百官志》記載，掖庭令屬下有暴室丞，“主中婦人疾病者，就此室治。”此相當于婦科診療室。

　　漢代為了控制流民，在疫病大流行期間曾設立過臨時醫(yī)院。“元始二年（公元2年）郡國大旱蝗。……詔民疾疫者，舍空邸第，為置醫(yī)藥。”（《漢書·平帝紀》），元嘉元年（151）京師疫病流行，朝廷派光祿大夫與太醫(yī)巡視疫情。在社會動蕩、政權(quán)不穩(wěn)的情況下，這些臨時防治疫病的組織也難以設置。