資源分配包括宏觀資源分配和微觀資源分配。醫(yī)療衛(wèi)生資源的宏觀分配指在國家能得到的全部資源中應(yīng)該把多少分配給衛(wèi)生保健，分配給衛(wèi)生保健的資源在醫(yī)療衛(wèi)生各部門之間如何分配，如癌癥研究應(yīng)分多少，預(yù)防醫(yī)學(xué)應(yīng)分多少，高技術(shù)醫(yī)學(xué)應(yīng)分多少等。宏觀分配還必須解決如下問題：政府是否應(yīng)負(fù)責(zé)醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)，還是把醫(yī)療事業(yè)留給市場，如果政府應(yīng)負(fù)責(zé)，則應(yīng)將多少預(yù)算用于醫(yī)療衛(wèi)生。如何最有效地使用分配給醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的預(yù)算，如預(yù)算應(yīng)集中于腎透析、器官移植、重癥監(jiān)護(hù)這些搶救方法，還是集中于疾病的預(yù)防；哪些疾病應(yīng)優(yōu)先得到資源的分配；以及為改變個人行為模式和生活方式（如吸煙），政府應(yīng)投入多少資源等等。資源的微觀分配指醫(yī)務(wù)人員和醫(yī)療行政單位根據(jù)什么原則把衛(wèi)生資源分配給病人，怎樣分配才算公正合理。

當(dāng)涉及稀有資源時，哪些病人可優(yōu)先獲得資源（如有兩個病人都需要腎移植，但只有一個腎可供移植時）。為了進(jìn)行微觀分配，首先需要規(guī)定一些規(guī)則和程序來決定哪些人可以得到這種資源，即根據(jù)適應(yīng)癥、年齡、治療成功的可能和希望、預(yù)期壽命和生命質(zhì)量等主要是醫(yī)學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行初篩；然后再規(guī)定一些規(guī)則和程序從這范圍中最后決定哪些人得到這種資源。這組規(guī)則和程序的規(guī)定常常要參照社會標(biāo)準(zhǔn)：病人的地位和作用、過去的成就、潛在的貢獻(xiàn)等。但對社會標(biāo)準(zhǔn)，爭議較多。

衛(wèi)生政策中最有爭論的問題是一個國家是否應(yīng)該讓醫(yī)療衛(wèi)生社會化，如應(yīng)實(shí)行公費(fèi)醫(yī)療或醫(yī)療保險，還是讓醫(yī)療衛(wèi)生商品化，還是采取某種混合折衷的方式（如醫(yī)療衛(wèi)生的基本需要由國家負(fù)責(zé)，而高技術(shù)醫(yī)學(xué)則由病人自己根據(jù)收入購買）。