哈門內(nèi)阿米巴形態(tài)與溶組織內(nèi)阿米巴極其相似而體積較小，曾一度被認為是它的共棲小宗。后經(jīng)研究從形態(tài)特征、生長代謝、免疫特性、藥物敏感及致病毒力等方面提出證據(jù)，確認為獨立種。滋養(yǎng)體直徑3～12μm，包囊4～10μm.滋養(yǎng)體與包囊的細胞結(jié)構(gòu)和胞核等特征，除大小外酷似非侵襲型的溶組織內(nèi)阿米巴，糖原泡不明顯，擬染色體細小，亦呈棒狀小體，也熟包囊也有4個核。

本蟲不致病，傳播及分布與溶組織內(nèi)的阿米巴相似，常并存感染，僅感染率較低，對硝基咪唑類藥物也不甚敏感醫(yī)學教育網(wǎng)|搜集整理。病原檢查時識別該蟲的單純感染具有縮小防治范圍的實際意義。流行病學調(diào)查中，測量包囊大小，以10μm為界線，可與痢疾阿米巴包囊相區(qū)別。大小在界線交叉范圍者鑒別十分困難，有時須借助血清學輔診。