根據(jù)上述職責，省衛(wèi)生廳設(shè)11個職能處室。

　　（一）辦公室（外事處）

　　協(xié)調(diào)廳機關(guān)政務(wù)、事務(wù)；負責機關(guān)文秘、信訪、保密、檔案工作，協(xié)調(diào)機關(guān)后勤管理工作；組織參與醫(yī)療衛(wèi)生方面的政府與民間的多邊、雙邊合作交流與衛(wèi)生援外工作；負責醫(yī)療衛(wèi)生方面的引進項目、勞務(wù)輸出等對外聯(lián)系工作；負責機關(guān)和直屬單位的外事活動管理。

　　（二）政策法規(guī)處

　　研究起草地方性衛(wèi)生法規(guī)、政策；負責全省衛(wèi)生體制改革并就重大問題進行調(diào)查研究；負責衛(wèi)生行政復(fù)議工作；指導(dǎo)地方衛(wèi)生法制建設(shè)及宣傳工作。

　　（三）規(guī)劃財務(wù)處

　　研究擬定全省衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展規(guī)劃；組織實施衛(wèi)生服務(wù)價格工作；負責對廳直單位國有資產(chǎn)管理；負責省本級衛(wèi)生預(yù)算經(jīng)費管理；提出并組織實施衛(wèi)生基本建設(shè)計劃；醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理組織國內(nèi)外衛(wèi)生貸款項目工作；負責對廳直單位的衛(wèi)生審計工作；負責衛(wèi)生信息統(tǒng)計工作。

　　（四）衛(wèi)生監(jiān)督處

　　研究擬定全省衛(wèi)生監(jiān)督工作的政策；監(jiān)督實施衛(wèi)生法律、法規(guī)、技術(shù)規(guī)范和標準；負責衛(wèi)生執(zhí)法監(jiān)督工作；監(jiān)督管理傳染病防治和食品、職業(yè)、環(huán)境、放射、學校衛(wèi)生工作；組織實施食品、化妝品質(zhì)量管理規(guī)范并負責認證工作；指導(dǎo)全省職業(yè)病防治工作。

　　（五）基層衛(wèi)生與婦幼保健處

　　研究擬定農(nóng)村衛(wèi)生、社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)的發(fā)展規(guī)劃；指導(dǎo)初級衛(wèi)生保健規(guī)劃的實施；指導(dǎo)城市基層衛(wèi)生服務(wù)體系的改革；組織落實婦幼衛(wèi)生和提高出生人口素質(zhì)工作的發(fā)展規(guī)劃、政策措施和技術(shù)標準；監(jiān)督母嬰保健專項技術(shù)服務(wù)的實施。

　　（六）醫(yī)政處

　　研究指導(dǎo)全省醫(yī)療機構(gòu)改革；擬定醫(yī)療機構(gòu)發(fā)展規(guī)劃和政策；負責實施地方性醫(yī)療法規(guī)；監(jiān)督管理醫(yī)療技術(shù)質(zhì)量標準、醫(yī)務(wù)人員執(zhí)業(yè)標準、服務(wù)規(guī)范和質(zhì)量的實施工作；依法監(jiān)督管理血站，單采血漿站的采供血及臨床用血質(zhì)量；負責醫(yī)德、醫(yī)風建設(shè)；負責醫(yī)療事故的技術(shù)鑒定；協(xié)助市、縣政府和有關(guān)部門對重大人員傷亡事故緊急救護。

　　（七）中醫(yī)處

　　研究擬定中醫(yī)、中藥、中西醫(yī)結(jié)合工作的有關(guān)政策、規(guī)章及中醫(yī)藥事業(yè)的發(fā)展規(guī)劃；組織實施中醫(yī)醫(yī)療、保健、中藥、中醫(yī)護理、中西醫(yī)結(jié)合等人員的技術(shù)職務(wù)評定標準和執(zhí)業(yè)資格標準；醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理指導(dǎo)和管理各類（包括個體）中醫(yī)醫(yī)療保健機構(gòu)；協(xié)調(diào)和指導(dǎo)中醫(yī)醫(yī)療、科研等體制改革；指導(dǎo)和監(jiān)督中醫(yī)醫(yī)療、預(yù)防、保健、康復(fù)、護理及臨床用藥；指導(dǎo)中醫(yī)藥科學研究、技術(shù)開發(fā)工作；負責中醫(yī)（藥）重大科研課題的攻關(guān)及轉(zhuǎn)化工作。

　　（八）疾病控制處（省愛國衛(wèi)生運動委員會辦公室）

　　研究擬定傳染病、地方病、慢性非傳染性疾病及與公共衛(wèi)生相關(guān)疾病的防治規(guī)劃和措施；依法組織對重大傳染病、地方病的綜合防治；組織全省衛(wèi)生技術(shù)力量，對重大突發(fā)疫情、病情實施緊急處置，防止和控制疫情、疾病的發(fā)生、蔓延；協(xié)調(diào)并指導(dǎo)健康教育工作。承擔省愛國衛(wèi)生運動委員會的日常工作。

　　（九）科技教育處

　　研究擬定醫(yī)學科技和醫(yī)學教育發(fā)展規(guī)劃、政策；指導(dǎo)醫(yī)學科技攻關(guān)、醫(yī)學科技成果的轉(zhuǎn)化、普及和應(yīng)用工作；指導(dǎo)醫(yī)學教育工作；管理非獨立的醫(yī)學科研機構(gòu)及集體、個體醫(yī)學科研機構(gòu)。

　　（十）保健辦公室

　　負責省管保健對象以及國家領(lǐng)導(dǎo)人和重要外賓在遼寧期間的醫(yī)療保健工作。

　　（十一）人事處

　　指導(dǎo)全省衛(wèi)生系統(tǒng)醫(yī)務(wù)人員及行政干部隊伍建設(shè)工作；醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理承辦并指導(dǎo)機關(guān)、直屬單位人事、勞動工資和機構(gòu)編制的管理工作；承辦直屬單位領(lǐng)導(dǎo)班子和機關(guān)干部的考核任免工作。

　　機關(guān)黨委負責廳機關(guān)及直屬單位的黨群工作。

　　設(shè)置紀檢組、監(jiān)察處合署辦公，負責紀檢和行政監(jiān)察工作。