上海交通大學藥學院由上海交通大學和上海醫(yī)藥工業(yè)研究院共建，于2000年2月26日成立，是上海交通大學的二級學院。

上海交通大學藥學院公共技術實驗室由七個實驗室組成：公共儀器實驗室、動物實驗室、細胞實驗室、同位素實驗室、藥物制劑工程實驗室、中藥提取工程實驗室和藥物合成實驗室。面積約1000平方米。公共技術實驗室成立于2005年，主要由“985工程”投資建成。至2007年，總投資近1200萬人民幣，擁有大型貴重精密儀器設備20余臺。典型的測試儀器有液質聯用儀、毛細管電色譜儀、分析及制備高效液相色譜儀、蛋白純化儀、流式細胞儀、超速離心機、熒光顯微鏡、光學顯微鏡、醫(yī)學教育|網搜集整理核酸蛋白分析儀、基因測序儀等多種類型的測試儀器。