安徽醫(yī)科大學教學單位：

截至2014年4月，該校設有基礎醫(yī)學院、公共衛(wèi)生學院、口腔醫(yī)學院（安徽省口腔醫(yī)院）、衛(wèi)生管理學院、生命科學院學院、護理學院、藥學院、人文社會科學學院、國際教育學院、公共基礎學院、研究生學院、成人教育學院（繼續(xù)教育學院）、臨床醫(yī)學院、第一臨床學院（第一附屬醫(yī)院）、第二臨床學院（第二附屬醫(yī)院）、巢湖臨床學院（附屬巢湖醫(yī)院）、第四臨床學院（第四附屬醫(yī)院）、醫(yī)學檢驗系、醫(yī)學影像系、麻醉學系、醫(yī)學心理學系、醫(yī)學美容系等直屬教學機構。

該校擁有5所直屬附屬醫(yī)院（第一附屬醫(yī)院、第二附屬醫(yī)院、第四附屬醫(yī)院、附屬巢湖醫(yī)院、附屬口腔醫(yī)院——安徽省口腔醫(yī)院），6所非直屬附屬醫(yī)院（附屬省立醫(yī)院、第三附屬醫(yī)院——合肥市第一人民醫(yī)院醫(yī)|學教育網整理、附屬合肥醫(yī)院——合肥市第二人民醫(yī)院、附屬安慶醫(yī)院——安慶市立醫(yī)院、附屬六安醫(yī)院——六安市人民醫(yī)院、附屬宿州醫(yī)院——宿州市立醫(yī)院），與合肥市共建附屬阜陽醫(yī)院。