中山大學藥學院是原中山大學和中山醫(yī)科大學兩校合并后于2002年6月成立的第一個新學院。學院以中山大學生命科學學院藥學系為基礎，整合了中山大學生命科學學院、化學與化學工程學院以及醫(yī)學院有關藥學科學研究的資源，以中山大學的綜合力量為依托組建而成。

現(xiàn)為藥學一級學科博士學位授予單位、藥學（一級學科）博士后科研流動站，擁有藥學本科專業(yè)一個。目前在讀全日制本科生468名，碩士研究生337名，博士研究生98名。本科生招生規(guī)模為每年120人，研究生招生規(guī)模呈穩(wěn)步增長態(tài)勢。

學院擁有國家級平臺“新藥成藥性評估與評價國家地方聯(lián)合工程實驗室”，藥學院藥物安全性評價中心通過國家GLP認證；擁有“廣東省新藥設計與評價重點實驗室”、“廣東省成藥性評估及評價工程實驗室”、“廣東省創(chuàng)新藥物制劑工程技術研究開發(fā)中心”、“廣東省現(xiàn)代中藥工程技術研究開發(fā)中心”、“廣東省高校手性合成技術工程中心”、“廣東省高校創(chuàng)新藥物制劑工程技術中心”及“廣東省藥學實驗教學示范中心”等8個省部廳級重點實驗室及工程研究中心，擁有中山大學臨床藥理研究所等校級研究機構4個。

學院擁有一支實力雄厚的高水平師資隊伍。現(xiàn)有教職工123人，其中教師69人，教師中教授28人醫(yī)學教育網(wǎng)編輯整|理，副教授28人，講師13人。博士生導師25人，碩士生導師56人。具有博士學位的教師達99%.中山大學“百人計劃”引進人才22人，先后4人享受國務院政府特殊津貼，4人入選教育部新世紀優(yōu)秀人才支持計劃，1人入選廣東省優(yōu)秀青年教師培養(yǎng)計劃有24人被列為“廣東省千百十工程”培養(yǎng)對象。

學院位于大學城，建筑面積2.3萬平方米。學院重視實驗室科研條件建設，現(xiàn)已購置了10萬元以上用于藥學科學研究的大型貴重儀器150多臺，如核磁共振儀、質譜儀、X-單晶衍射儀、熒光光譜儀、全自動細胞組學高內涵篩選和分析系統(tǒng)、激酶篩選系統(tǒng)、生物大分子相互作用分析儀、激光共聚焦顯微鏡、CO2超臨界萃取儀、全自動生化儀、紅外光譜儀、各種高效液相色譜儀、軟膠囊機、流化床包衣機、擠出-滾圓造粒機等等。購置儀器3000多件，總價值逾億元。

學院對外交流活躍，近年主辦或承辦的大型國際學術會議、全國性學術會議有：2004年主辦了“精細化工與藥物合成國際研討會”；2008年9月，學院承辦了“第十一次全國臨床藥理學學術大會”；2009年10月，學院主辦了首屆“國際工業(yè)藥學與臨床藥學研討會”。2011年9月，承辦了國際藥物代謝學會聯(lián)合學術會議。2011年11月，承辦了全國藥物化學學術會議暨第三屆中英藥物化學學術會議。2012年12月，學院主辦了第二屆“國際工業(yè)藥學與臨床藥學研討會”。2013年12月，主辦了第一屆嶺南國際DMPK論壇。開辦“藥學前沿大講壇”系列學術報告，邀請國內外知名專家、學者及企業(yè)家代表參加，自2008年來累計報告191場次。

學院的總體發(fā)展目標是，以創(chuàng)新藥物研究為龍頭，組建與國際接軌的公共技術平臺。借助學校的整體力量，將藥學院辦成具有國內先進水平，某些領域在國際上有較大影響的科學研究與高層次人才培養(yǎng)基地，特別是培養(yǎng)創(chuàng)新藥物的團隊和人才。使藥學院成為廣東省和全國的藥物（新藥）研究、開發(fā)與評價中心及藥學人才培養(yǎng)基地。