主要有以下四種方法：

　　按臟腑辨證配穴

　　就是根據(jù)中醫(yī)的傳統(tǒng)理論來選穴組成處方。如中醫(yī)學(xué)認(rèn)為“肺主皮毛”，故可取肺穴治療皮膚??；腎，“其華在發(fā)”，故可取腎穴治療斑禿等。

　　按現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論配穴

　　耳穴中有不少是按現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的名稱命名的，如皮質(zhì)下、交感、腎上腺、內(nèi)分泌、耳迷根等。這些穴位的功能和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)所說的基本一致，如腎上腺穴，有近似調(diào)節(jié)腎上腺的功能，故可按現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論配穴。

　　按相應(yīng)部位配穴

　　此法最為簡單，臨床上用得也最廣泛。即醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理根據(jù)病變所在，在耳郭對應(yīng)的部位取穴配方。如肩周炎取肩穴，胃炎取胃穴等。

　　按臨床經(jīng)驗(yàn)配穴

　　指對臨床中發(fā)現(xiàn)，對某一或某些病癥有獨(dú)特作用的穴位進(jìn)行組方。如耳尖穴治高血壓、耳中穴治隔肌痙攣等。

　　在實(shí)際治療中，上面各種配穴常綜合運(yùn)用，如高血壓，可據(jù)西醫(yī)理論取交感，按臟腑學(xué)說加心，據(jù)臨床經(jīng)驗(yàn)加耳尖等。