經(jīng)過(guò)全國(guó)十幾所高等藥學(xué)院校及有關(guān)專家調(diào)研論證，執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育整個(gè)課程體系分為兩大類，一是藥學(xué)類，二是中藥學(xué)類。

每一大類里又分為專業(yè)基礎(chǔ)課、專業(yè)課、拓展課和研討課四種，課程總數(shù)為32門。藥學(xué)類共設(shè)20門課程，其中專業(yè)基礎(chǔ)課3門、專業(yè)課6門、拓展課6門、研討課5門。中藥學(xué)類共設(shè)20門課程。其中專業(yè)基礎(chǔ)課4門、專業(yè)課6門、拓展課5門、研討課5門。在藥學(xué)類和中藥學(xué)類課程中，內(nèi)容完全相同的有8門課程，故采用同一個(gè)教學(xué)大綱，稱為共用課程翳學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

如果同時(shí)考取了執(zhí)業(yè)中藥師和執(zhí)業(yè)西藥師，繼續(xù)教育時(shí)只要取得15學(xué)分即可，也就是說(shuō)不用為了兩個(gè)證書分別繼續(xù)教育。