土壤環(huán)境的自凈作用即土壤環(huán)境的自然凈化作用（或凈化功能的作用過程），是指進入土壤的物質(zhì)，通過稀釋和擴散等作用可以降低其濃度，或者被轉(zhuǎn)化為不溶性化合物而沉淀，或為膠體牢固地吸附，從而暫時脫離生物小循環(huán)及食物鏈；或者通過生物和化學(xué)的降解作用，轉(zhuǎn)化為無毒或毒性小的物質(zhì)，甚至成為營養(yǎng)物質(zhì)；或經(jīng)揮發(fā)和淋溶從土體中遷移至大氣和水體，所有這些現(xiàn)象都可以理解為土壤的自凈過程，但土壤的自凈主要是指生物和化學(xué)的降解作用。

土壤的凈化作用包括如下內(nèi)容：

1.物理凈化作用 土壤是一個多相的疏松多孔體，進入土壤中的難溶性固體污染物可被土壤機械阻留；可溶性污染物可被土壤水分稀釋，降低毒性，或被土壤固相表面吸附，但可隨水遷移至地表水或地下水層；某些污染物可揮發(fā)或轉(zhuǎn)化成氣態(tài)物質(zhì)通過土壤孔隙遷移到大氣介質(zhì)中。

2.化學(xué)凈化作用 污染物進入土壤后，可以發(fā)生一系列化學(xué)反應(yīng)。如凝聚與沉淀反應(yīng)、氧化還原反應(yīng)、絡(luò)合-螯合反應(yīng)、酸堿中和反應(yīng)、水解、分解化合反應(yīng)，或者發(fā)生由太陽輻射能和紫外線等引起的光化學(xué)降解作用等。通過上述化學(xué)反應(yīng)使污染物分解為無毒物質(zhì)或營養(yǎng)物質(zhì)。但對于性質(zhì)穩(wěn)定的化合物如多氯聯(lián)苯、稠環(huán)芳烴醫(yī)`學(xué)教育網(wǎng)整理、塑料和橡膠等難以被化學(xué)凈化；重金屬通過化學(xué)凈化不能被降解，只能使其遷移方向發(fā)生改變。

3.生物凈化作用 土壤中存在大量依靠有機物生存的微生物，它們具有氧化分解有機物的巨大能力，是土壤環(huán)境自凈作用中最重要的凈化途徑之一。各種有機污染物在不同條件下分解的產(chǎn)物多種多樣，并最終轉(zhuǎn)化為對生物無毒的物質(zhì)。

（1）病原體的死滅：病原體進入土壤后，受日光的照射，土壤中不適宜病原微生物生存的環(huán)境條件，微生物間的拮抗作用，噬菌體作用，以及植物根系分泌的殺菌素等許多不利因素的作用下而死亡。

（2）有機物的凈化：土壤中的有機污染物在微生物的作用下，醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理使有機物逐步無機化或腐殖質(zhì)化。

含氮有機物在土壤微生物的作用下，分解成氨或氨鹽，稱為氨化階段。在氧氣充足和亞硝酸菌的作用下，氨被氧化成亞硝酸鹽，進一步在硝酸菌的作用下氧化成硝酸鹽，稱為硝化階段。不含氮有機物也可在土壤微生物的作用下發(fā)生分解。含碳有機物在氧氣充足的條件下最終形成二氧化碳和水，在厭氧條件下則產(chǎn)生甲烷。含硫和磷的有機物，在氧氣充足的條件下最終分別形成硫酸鹽或磷酸鹽。在厭氧條件下則產(chǎn)生硫醇醫(yī)`學(xué)教育網(wǎng)整理、硫化氫或磷化氫的等惡臭物質(zhì)，與含氮、碳有機物產(chǎn)生的氨、甲烷等一起以惡臭污染環(huán)境。

有機物在土壤微生物的參與下不斷分解又不斷合成，最后變成腐殖質(zhì)（humus）的過程稱為有機物的腐殖化。腐殖質(zhì)的成分很復(fù)雜，其中含有木質(zhì)素、蛋白質(zhì)、碳水化合物、脂肪和腐殖酸等。腐殖質(zhì)的化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定，病原體已經(jīng)死滅，不招引蒼蠅，無不良氣味，質(zhì)地疏松，在衛(wèi)生上是安全的，又是農(nóng)業(yè)上良好的肥料。常用的人工堆肥法就是使大量有機污染物在短時間內(nèi)轉(zhuǎn)化為腐殖質(zhì)而達到無害化的目的。

土壤中的污染物被生長的植物所吸收、降解，并隨莖葉、種子離開土壤；或被土壤中的蚯蚓等軟體動物所食用等也屬于土壤環(huán)境生物凈化作用。