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細菌的分解代謝產(chǎn)物因各種細菌具備的酶不完全相同，而有所差異。各代謝產(chǎn)物可通過生化試驗的方法檢測，通常稱為細菌的生化的反應。

1.糖代謝測定

（1）糖發(fā)酵試驗：細菌對各種糖的分解能力及代謝產(chǎn)物不同，可借以鑒別細菌。一般非致病菌能發(fā)酵多種單糖，如大腸桿菌能分解葡萄糖有乳糖，產(chǎn)生甲酸等產(chǎn)物，并有甲酸解氫酶，可將其分解為CO2和H2，故生化反應結(jié)果為產(chǎn)酸產(chǎn)氣，以“⊕”表示。傷寒桿菌分解葡萄糖產(chǎn)酸，但無解氫酶。故生化結(jié)果為產(chǎn)酸不產(chǎn)氣，以“+”表示。傷寒桿菌及一般致病菌大都不能分解乳糖，以“-”表示。

（2）VP試驗：大腸桿菌與產(chǎn)氣桿菌均分解葡萄糖⊕，為區(qū)分兩菌可采用VP試驗及甲基紅試驗。產(chǎn)氣桿菌能使丙酮酸脫羧、氧化（在堿性溶液中）生成二乙酰，后者可與含胍基的化合物反應，生成紅色化合物，稱VP陽性。大腸桿菌分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸，VP陰性。

（3）甲基紅試驗：產(chǎn)氣桿菌使丙酮酸脫羧后形成中性產(chǎn)物，培養(yǎng)液pH>5.4，甲基紅指示劑呈桔黃色，為甲基紅試驗陰性，大腸桿菌分解葡萄糖產(chǎn)生丙酮酸，培養(yǎng)液呈酸性pH<5.4，指示劑甲基紅呈紅色，稱甲基紅試驗陽性。

（4）枸櫞酸鹽利用試驗：能利用枸櫞酸鹽作為唯一碳源的細菌如產(chǎn)氣桿菌，分解枸櫞酸鹽生成碳酸鹽，同時分解培養(yǎng)基的銨鹽生成氨，由此使培養(yǎng)基變?yōu)閴A性，使指示劑溴麝香草酚藍（BTB）由淡綠轉(zhuǎn)為深藍，此為枸櫞酸鹽利用試驗陽性。、

2.蛋白質(zhì)代謝測定

（1）吲哚試驗：含有色氨酸酶的細菌（如大腸桿菌、變形桿菌等）可分解色氨酸生成吲哚，若加入二甲基氨基苯甲醛，與吲哚結(jié)合，形成玫瑰吲哚，呈紅色，稱吲哚試驗陽性。

（2）硫化氫試驗：變形桿菌、乙型副傷寒桿菌等能分解含硫氨基酸如胱氨酸、甲硫氨酸等，生成硫化氫。在有醋酸鉛或硫酸亞鐵存在時，則生成黑色硫化鉛或硫化亞鐵，可借以鑒別細菌。

3.尿素分解試驗

變形桿菌具有尿素酶，可分解尿素產(chǎn)生氨，培養(yǎng)基呈堿性，以酚紅為指示劑檢測呈紅色，由此區(qū)別于沙門氏菌。

吲哚（I）、甲基紅（M）、VP（V）、枸櫞酸鹽利用（C）四種試驗，常用于鑒定腸道桿菌，合稱之為IMViC試驗。大腸桿菌呈“++——”，產(chǎn)氣桿菌為“——++”。

氣相、液相色譜法通過對細菌分解代謝產(chǎn)物中揮發(fā)性或不揮發(fā)性有機酸和醇類的檢測，可準確、快速地確定細菌的種類，是目前進行細菌生化鑒定的高新技術。