在蛋白質(zhì)分子中，肽鍵、氫鍵、二硫鍵、疏水作用力和范德華力等對(duì)于維持其結(jié)構(gòu)都起著重要作用。但如果要說(shuō)哪一種最為關(guān)鍵，通常認(rèn)為肽鍵是基礎(chǔ)，它通過(guò)氨基酸之間的連接形成了蛋白質(zhì)的主鏈，是蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)。除此之外，次級(jí)結(jié)構(gòu)（如α-螺旋和β-折疊）主要由氫鍵穩(wěn)定；而三級(jí)結(jié)構(gòu)則依賴于多種作用力，包括但不限于二硫鍵、疏水作用力和范德華力等，這些力量共同決定了蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象，對(duì)維持其生物活性至關(guān)重要。

在特定情況下，某些類型的鍵可能顯得更加重要。例如，在需要高度穩(wěn)定的蛋白質(zhì)中，如酶的活性中心或細(xì)胞膜蛋白中，二硫鍵可以提供額外的穩(wěn)定性；而在水溶性區(qū)域，氫鍵和疏水作用力則更為關(guān)鍵。因此，可以說(shuō)每種鍵都在不同層面上對(duì)維持蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)揮著不可或缺的作用，但肽鍵作為構(gòu)建蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)，在生物學(xué)意義上被認(rèn)為是最重要的。