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即以病例和對照個體為單位進行匹配。1:1匹配，為每一個病例配一名對照，又稱配對，1:2、1:3、…、1:R匹配時，直接稱為匹配。

定量指標一般要求在一定范圍內匹配。例如年齡匹配，病例為50～59歲組，則對照亦應為50～59歲組。或者要求對照在±2歲、±3歲或±5歲等范圍內匹配，如要求對照與病例的年齡之差在±3歲之內，則一個39歲的病例，其對照的年齡應當在36～42歲之間。

在病例對照研究中采用匹配的目的，首先在于提高研究效率，增加分析指標的精確度（即可信區(qū)間變窄）。其次在于控制混雜因素的作用。匹配的特征或變量必須是已知的混雜因子，或有充分的理由懷疑為混雜因子，否則不應匹配。